患有短期健忘症的多莉（艾伦·德杰尼勒斯暂无内容Ellen暂无内容DeGeneres暂无内容配音）曾经也拥有美好的家庭，然而一连串的意外让她与和蔼可亲的父母失散。此去经年，多莉邂逅了小丑鱼父子马林（艾伯特·布鲁克斯暂无内容Albert暂无内容Brooks暂无内容配音）和尼莫（海登·罗兰斯暂无内容Hayden暂无内容Rolence暂无内容配音），与他们经历了前所未有的大冒险。平静的日子里，童年时期的片段记忆突然闯入多莉的脑海，于是她再度踏上寻找父母的旅程。这一次，她来到了海洋生物博物馆，遇到了不打算回到大海的章鱼汉克（艾德·奥尼尔暂无内容Ed暂无内容O'Neill暂无内容配音）以及童年时的朋友鲸鲨运儿（凯特琳·奥尔森暂无内容Kaitlin暂无内容Olson暂无内容配音）。循着记忆中的蛛丝马迹，她离父母越来越近。然而在这一过程中，她又和马林父子失散了。